数据集概述
本数据集是PLOS ONE论文相关的欧洲狼(Canis lupus)种群遗传研究数据,包含11个国家177只狼的67K+单核苷酸多态性(SNP)位点分析结果,揭示其南北分化格局与高多样性区域特征,支持意大利种群隔离、喀尔巴阡山脉种群遗传中间性等发现,为狼种群保护管理提供遗传依据,共14个文件。
文件详解
- 说明文档(README文件)
- 文件名称:README_for_Northcentral_Europe.txt、README_for_Carpathians.txt、README_for_Dinaric-Balkan.txt、README_for_Ukrainian_Steppe.txt、README_for_WolvesAll_22feb2012.txt、README_for_Italy.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:各区域及全样本数据的说明文档,包含数据背景、使用方法等信息
- 样本信息文件
- 文件名称:WolvesAll_Sample information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:177只欧洲狼样本的基础信息
- PLINK格式遗传数据文件
- 文件名称:WolvesAll_22feb2012.ped、WolvesAll_22feb2012.map
- 文件格式:PED、MAP
- 字段映射介绍:PLINK软件兼容的遗传数据文件,包含67K+SNP位点的基因型信息(PED)及位点定位信息(MAP)
- 区域遗传分析结果文件
- 文件名称:Dinaric-Balkan.txt、Northcentral_Europe.txt、Italy.txt、Ukrainian_Steppe.txt、Carpathians.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:各区域狼种群的SNP位点分析结果,包含CHR(染色体)、SNP(位点ID)、TEST(测试类型)、A1/A2(等位基因)、GENO(基因型分布)、OHET/EHET(观测/期望杂合度)、P(P值)等字段
数据来源
PLOS ONE论文“North-south differentiation and a region of high diversity in European wolves (Canis lupus)”
适用场景
- 欧洲狼种群遗传结构研究: 分析不同地理区域狼种群的遗传分化、基因流及种群聚类特征
- 遗传多样性评估: 探究意大利、白俄罗斯等区域狼种群的遗传多样性水平差异及其成因
- 物种保护管理: 为欧洲狼的重新定殖区域规划、种群复壮策略制定提供遗传数据支持
- 进化生物学研究: 验证冰川避难所扩张、环境适应对狼种群遗传格局的影响机制
- 分子生态学分析: 利用SNP位点数据开展狼种群的亲缘关系、近交程度等研究