数据集概述
本数据集围绕杨树杂交带大型克隆集群的成因与演化展开，包含核微卫星标记数据、GBS原始测序数据及分析脚本等7个文件。研究聚焦杜罗河流域的银白杨克隆种群，通过遗传标记分析克隆成功的基因组背景及演化后果，揭示无性繁殖对种群生存的影响。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称：GBS_raw_data_1.tar.gz、GBS_population_maps.tar.gz、GBS_barcodes.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：包含基因分型测序（GBS）原始数据、种群分布图及样本条形码信息，用于种群遗传分析的基础数据输入
- 表格数据文件
- 文件名称：Datafile_21x533.xlsx、Datafile_52x137.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含核微卫星标记的基因型数据矩阵，21行×533列及52行×137列的表格结构，记录不同样本的遗传标记信息
- 分析脚本文件
- 文件名称：Scripts.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：包含STACKS分析流程脚本，用于处理GBS数据的生物信息学分析工具
- 说明文档
- 文件名称：README_for_Scripts.tar.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：提供数据分析的操作指南，包括工作目录创建、脚本运行步骤及环境要求（如Ubuntu 14.04 LTS系统）
数据来源
论文“Causes and consequences of large clonal assemblies in a poplar hybrid zone”
适用场景
- 植物克隆繁殖机制研究: 分析杨树杂交带无性繁殖对种群遗传结构的影响
- 基因组渐渗分析: 探究银白杨与欧洲山杨的基因交流对克隆成功的作用机制
- 种群演化历史重建: 通过GBS数据估算大型克隆的年龄及种群有效大小变化
- 生物信息学分析流程应用: 利用STACKS脚本复现植物遗传标记的数据分析过程
- 植物保护策略制定: 基于克隆集群的遗传多样性特征，评估种群生存风险并制定保护措施
