数据集概述
本数据集围绕灵长类多样化研究展开,整合约600种化石物种数据与覆盖90%现生物种的系统发育树,验证灵长类多样化的两个核心假设:多样化速率随时间增加、渐新世存在显著灭绝事件。数据集包含原始数据、模型结果、分析代码及补充材料,共6个文件,支持对比化石与系统发育数据对多样化模式的不同推断。
文件详解
- 数据文件(.xlsx格式,共3个)
- 文件名称:Table S3. Raw data on fossils.xlsx
- 内容:灵长类化石物种原始数据
- 文件名称:Table S4. PBDB raw data.xlsx
- 内容:来自PBDB(古生物数据库)的原始数据
- 文件名称:Table S1. Model fit results.xlsx
- 内容:多样化速率模型拟合结果
- 代码文件(.r格式,共1个)
- 文件名称:R code for Herrera Primate diversification2.R
- 内容:用于灵长类多样化分析的R语言代码
- 系统发育树文件(.tre格式,共1个)
- 文件名称:springer_trees.tre
- 内容:灵长类现生物种的系统发育树数据
- 文档文件(.docx格式,共1个)
- 文件名称:Supplementary materials for Primate diversification round 3.docx
- 内容:灵长类多样化研究的补充材料
数据来源
论文“Primate diversification inferred from phylogenies and fossils”
适用场景
- 灵长类进化研究: 分析灵长类物种形成与灭绝速率的时间动态模式
- 古生物数据与分子系统发育整合分析: 对比化石记录与现生物种系统发育树对多样化推断的差异
- 生物多样性模型验证: 测试多样化速率随时间变化及灭绝事件的假设
- 进化生物学方法学研究: 探索整合灭绝谱系信息优化系统发育分析的方法