数据集概述
本数据集为包含水稻黄单胞菌PXO35菌株8个组装变体的ProgressiveMauve比对结果。这些变体来自不同组装程序和测序技术,主要比对文件为"PXO35_assembly_comparison",可通过Mauve程序交互查看,数据集仅含1个压缩文件。
文件详解
- 文件名称:interactiveMauvePXO35_Assemblies.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含ProgressiveMauve算法生成的Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO35菌株8个组装变体的比对文件,核心文件为"PXO35_assembly_comparison",支持通过Mauve程序交互查看基因组比对结果。
适用场景
- 基因组组装质量评估: 对比不同组装程序和测序技术生成的PXO35菌株组装变体的一致性与差异。
- 水稻黄单胞菌基因组结构分析: 利用ProgressiveMauve比对结果研究菌株基因组的结构变异、保守区域分布。
- 生物信息学工具验证: 验证ProgressiveMauve算法在细菌基因组多组装变体比对中的应用效果。
- 植物病原菌基因组研究: 为水稻黄单胞菌致病机制相关的基因组特征分析提供基础比对数据。