数据集概述
本数据集包含牛催乳素信号通路功能互作突变相关的基因型和表型数据，涉及毛发与皮肤表型（如hairy和slick性状）的遗传分析。数据涵盖基因型文件、生理表型数据、TaqMan验证结果等，共7个文件，支持牛催乳素信号通路突变与表型关联的研究。
文件详解
- 基因型与表型数据压缩包
- 文件名称：gen_phen_data_for_paper.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含论文所用的基因型与表型关联数据
- 染色体区域VCF文件
- 文件名称：rtg_3.3.1_556_animal_Chr23:30627379-40627379_for_dryad.vcf.gz
- 文件格式：VCF.GZ
- 字段映射介绍：牛23号染色体特定区域的基因型数据
- 生理表型数据压缩包
- 文件名称：physiological_phenos.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：牛生理表型相关数据
- 相位基因型与表型数据压缩包
- 文件名称：phased_gen_phen_data_slick.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：slick表型相关的相位基因型与表型数据
- 毛发公牛后代TaqMan验证结果
- 文件名称：Hairy_bull_progeny_TaqMan_results.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含Animal_Birth_id（动物出生ID）、Animal_Key（动物编号）、Verified_Sire（验证父本）、Presumed_Sire（推测父本）、Status（状态）、Test_result（检测结果）等字段
- 外显子区域VCF文件
- 文件名称：GATK-10MB-Window-Exomes.vcf.gz
- 文件格式：VCF.GZ
- 字段映射介绍：外显子区域10MB窗口的基因型数据
- 关联分析结果压缩包
- 文件名称：DFAM_assoc_results.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：DFAM关联分析结果数据
数据来源
论文“Functionally reciprocal mutations of the prolactin signalling pathway define hairy and slick cattle”
适用场景
- 动物遗传学研究：分析催乳素信号通路突变与牛表型（如毛发、皮肤性状）的关联
- 牛分子育种应用：基于基因型数据开发牛表型分子标记，用于育种选择
- 生理表型关联分析：探究牛生理表型与催乳素信号通路的遗传机制
- 突变验证研究：利用TaqMan结果验证催乳素信号通路突变的遗传效应
