数据集概述
本数据集围绕假单胞菌属（Pseudomonas）中抗生素耐药性突变的适应性效应展开，重点研究rpoB基因（RNA聚合酶β亚基）耐药突变与遗传背景的上位性互作。通过分析8株覆盖假单胞菌属多样性的菌株，揭示耐药突变适应性成本的背景依赖性，以及转录效率与适应性的关联，为理解耐药性在病原菌群体中的传播机制提供数据支持。
文件详解
- 文件名称：Vogwill Background summary data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含假单胞菌属不同菌株中rpoB耐药突变的适应性效应数据，涵盖突变类型、遗传背景菌株信息、适应性成本测量值、转录效率相关指标等核心字段，用于分析上位性互作及转录效率对适应性的影响。
数据来源
论文“Epistasis between antibiotic resistance mutations and genetic background shape the fitness effect of resistance across species of Pseudomonas”
适用场景
- 微生物耐药性机制研究：分析rpoB耐药突变在不同遗传背景下的适应性效应差异。
- 上位性互作分析：探究耐药突变与基因组其他区域的遗传互作模式。
- 转录调控与适应性关联研究：验证转录效率对耐药突变适应性的影响机制。
- 病原菌耐药性传播预测：为评估耐药性在假单胞菌属群体中的扩散潜力提供数据支持。
