数据集概述
本数据集围绕金合欢蚁（Pseudomyrmex ferrugineus群）与Vachellia宿主植物的共生关系展开，通过系统基因组学方法（超保守元件序列捕获）研究其进化历史，包括趋同进化、生物地理背景及相互作用起源，共包含8个文件。
文件详解
- beast-xml-files.zip（ZIP格式）：包含BEAST分析相关的XML文件
- all-tables-in-csv-xlsx-formats.zip（ZIP格式）：包含所有表格数据，格式为CSV和XLSX
- all-trees-in-nexus-pdf-formats.zip（ZIP格式）：包含所有系统发育树数据，格式为NEXUS和PDF
- BioGeoBEARS-files.zip（ZIP格式）：包含BioGeoBEARS分析相关文件
- concatenated-matrix-with-1672loci.nexus（NEXUS格式）：包含1672个基因座的串联矩阵
- partitioning-files-raxml-format.zip（ZIP格式）：包含RAXML格式的分区文件
- Trait-Reconstruction.zip（ZIP格式）：包含性状重建相关文件
- uce-contigs-aligned-untrimmed.zip（ZIP格式）：包含未修剪的超保守元件（UCE）重叠群对齐文件
数据来源
论文“The acacia ants revisited: convergent evolution and biogeographic context in an iconic ant/plant mutualism”
适用场景
- 生物共生关系研究：分析金合欢蚁与Vachellia植物的共生互作机制及进化历史
- 趋同进化分析：探究两种金合欢蚁谱系趋同占据宿主植物并演化出保护行为的过程
- 生物地理分布研究：基于生物地理分析文件，研究金合欢蚁的起源地及扩散路径
- 系统发育树构建：利用串联矩阵和系统发育树文件，构建金合欢蚁的系统发育关系
- 性状重建分析：通过性状重建文件，研究金合欢蚁与植物互作相关性状的演化过程
