数据集概述
本数据集记录了三种草本植物(黑麦草、草地早熟禾、高羊茅)的十个品种通过两阶段植物-土壤反馈(PSF)实验获得的种间与种内反馈效应数据,包含植物生物量测量结果及根际细菌、真菌的测序关联数据,用于探究PSF效应的驱动微生物类群及种内变异情况。
文件详解
- 细菌相关文件(共3个)
- 文件名称:otu_bacteria.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含细菌ASV(扩增子序列变体)的丰度数据,列名为ASV编号(如ASV1、ASV2等)
- 文件名称:taxa_bacteria.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:细菌ASV对应的分类学注释信息,关联OTU编号与微生物分类单元
- 文件名称:sample_data_bacteria.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:细菌样本的元数据信息,包含样本编号、处理组等实验背景数据
- 真菌相关文件(共3个)
- 文件名称:otu_fungi.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含真菌ASV的丰度数据,列名为ASV编号
- 文件名称:taxa_fungi.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:真菌ASV对应的分类学注释信息
- 文件名称:sample_data_fungi.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:真菌样本的元数据信息,包含样本编号、处理组等实验背景数据
- 植物生物量文件(共1个)
- 文件名称:plant-biomass.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录各草本植物品种在不同土壤处理下的总生物量测量数据,用于计算PSF效应值
数据来源
论文“Inter- and infraspecific plant-soil feedbacks of grass species”
适用场景
- 植物-土壤反馈效应分析:研究草本植物种间、种内PSF效应的方向(正/负)与强度
- 微生物驱动机制探究:关联植物生物量数据与根际细菌(变形菌门、厚壁菌门等)、真菌(子囊菌门等)的丰度,识别PSF效应的关键驱动微生物
- 植物种内变异研究:分析同一草本植物不同品种间PSF效应的差异情况
- 植物育种潜力评估:基于种内PSF变异结果,评估通过育种改良植物PSF相关性状的可能性