普通王蛇物种复合体谱系结构数据集

数据集概述

本数据集围绕普通王蛇物种复合体(Lampropeltis getula)的谱系结构展开,包含基因组序列数据、环境变量数据及分析结果文件,用于研究北美地区气候、地理与历史对其遗传分化及谱系形成的影响。

文件详解

  • 遗传数据文件:
  • Lgetula_p123_v2_25miss.vcf、Lgetula_p123_v4_25miss.vcf等:VCF格式文件,包含不同版本的基因组变异数据
  • Lgetula_p123_v2_25miss.ugeno、Lgetula_p123_v4_25miss.ugeno等:.ugeno格式遗传数据文件
  • Lgetula_p123_v2_25miss.ustr、Lgetula_p123_v4_25miss.ustr等:.ustr格式结构分析数据文件
  • 环境变量数据:
  • all_coords_current_bioclim.csv:CSV格式,包含生物气候变量坐标数据
  • all_coords_requested.csv:CSV格式,包含样本请求坐标数据
  • all_coords_current_envirem.csv:CSV格式,包含环境变量坐标数据
  • 分析结果与补充文件:
  • Table_S1_SUPP_FSC_estimates_AIC.csv:CSV格式,FSC模型AIC估计结果表
  • Supp_figs_Lgetula_Harrington_Burbrink.pdf:PDF格式,补充图表文件
  • Appendix_1.xlsx:Excel格式,附录文件
  • curMK3_MSFS.obs:观测数据文件,可能为MSFS分析结果
  • Lgetula_p123_v2_25missFSCpops_k3.txt:TXT格式,FSC种群分组文件,包含样本ID与分组信息
  • 说明文件:
  • README.txt:TXT格式,数据集说明文档

适用场景

  • 进化生物学研究:分析普通王蛇物种复合体的遗传分化与谱系形成机制
  • 生物地理学研究:探究北美地区气候与地理对物种遗传结构的影响
  • 种群遗传学分析:研究种群隔离、基因流及二次接触的动态过程
  • 环境关联分析:验证干旱、降水等环境因子与遗传距离的相关性
  • 谱系地理学教学:作为案例数据展示基因组学方法在物种分化研究中的应用
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 326.74 MiB
最后更新 2025年12月19日
创建于 2025年12月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。