数据集概述
本数据集为研究银行田鼠与PUUV病毒相互作用对NE流行病学生态进化过程影响的实验与基因组数据,包含实验样本与测序信息表、MiSeq测序数据,用于分析不同PUUV菌株与田鼠的相互作用对病毒复制、多样性及传播的影响,助力揭示法国NE流行病学异质性的驱动机制。
文件详解
- 文件名称:Samples_and_sequencing_informations.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含实验样本的基本信息(如来源地区、感染组合等)及测序相关信息(如测序平台、文库构建等),为实验设计与测序数据解读提供基础支撑。
- 文件名称:MiSeq sequencing Run1to3.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:压缩格式的MiSeq测序数据,涵盖Run1至Run3的基因组测序结果,用于分析PUUV病毒的遗传多样性、株系差异及病毒在宿主内的进化动态。
数据来源
论文“How Bank Vole-PUUV Interactions Influence the Eco-Evolutionary Processes Driving Nephropathia Epidemica Epidemiology—An Experimental and Genomic Approach”
适用场景
- 病毒-宿主相互作用研究:分析不同PUUV菌株与银行田鼠的遗传适配性对病毒复制、多样性的影响机制。
- NE流行病学驱动因素分析:探究病毒株系差异及宿主-病毒相互作用对法国NE疫情地理异质性的贡献。
- 病毒进化动态研究:通过基因组测序数据解析PUUV病毒在实验条件下的进化轨迹与遗传变异规律。
- 公共卫生风险评估:基于病毒传播相关的实验结果,评估不同地区PUUV病毒向人类传播的潜在风险。