数据集概述
本数据集包含206个共分级质谱（CF-MS）实验的处理后色谱图矩阵，由MaxQuant（1.6.5.0版本）完成数据库搜索与蛋白质定量，过滤了潜在污染物、反向匹配及仅通过修饰肽段鉴定的蛋白质。每个实验提供多种定量策略的色谱图及元数据，同时包含MaxQuant原始输出文件，完整数据可从PRIDE库PXD022048获取。
文件详解
- README
- 文件格式：无扩展名
- 内容介绍：数据集说明文档，概述数据来源、处理流程、文件结构及各文件内容说明
- Chromatograms.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容介绍：包含206个CF-MS实验的处理后色谱图矩阵，每个实验对应多种蛋白质定量策略（label-free数据集含iBAQ、MaxLFQ、MS1强度、谱计数；SILAC/二甲基标记数据集含同位素体比率），每个目录内附元数据文件说明色谱图矩阵行信息
- Protein groups.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容介绍：包含每个MaxQuant搜索的原始输出文件proteinGroups.txt
数据来源
PRIDE repository（accession PXD022048）
适用场景
- 蛋白质组学定量分析：利用不同定量策略（iBAQ、MaxLFQ等）的色谱图数据，研究蛋白质表达水平及差异
- 共分级质谱实验验证：通过处理后色谱图矩阵验证CF-MS实验的蛋白质鉴定与定量结果
- 质谱数据分析方法优化：对比不同定量策略的输出，优化蛋白质组学数据处理流程
- 生物信息学数据库补充：作为PRIDE库PXD022048的补充数据，支持相关蛋白质组学研究的复现与扩展分析
