PyRATES_Based_北美犬科大型超肉食性迭代演化研究数据

数据集概述

本数据集基于北美犬科动物4000万年化石记录,研究大型超肉食性(饮食中肉类占比超70%)的迭代演化对物种和支系的影响,包含演化模型代码、古生物分布数据、生存分析数据及统计结果等12个文件,用于验证超肉食性对灭绝风险的约束作用。

文件详解

  • 代码文件(.R):共6个,包含演化分析、生存模型、速率变化检测等代码,如codeS1_Fig2_survivorVictim_logistic.R(生存分析逻辑回归)、codeS3_Fig4_PyRATES_perSubfam_rateShifts.R(支系速率变化检测)
  • 数据文件(.csv/.xlsx):共5个,包含物种体型与食性数据(datasetS1_m1L-BL-DL-m1BS-JL-predPreyMass-dur.csv)、古生物分布数据(datasetS4_FAUNMAP_PBDB_occs.csv)、列联表(datasetS2_contingencyTables.xlsx)等
  • 压缩文件(.zip):1个,datasetS5_pyrate_mcmc_logs.zip,包含MCMC模拟日志数据
  • 统计结果文件(.xlsx):1个,datasetS6_BenjaminiHochberg.xlsx,包含多重检验校正结果

数据来源

论文“Iterative evolution of large-bodied hypercarnivory in canids benefits species but not clades”

适用场景

  • 宏演化生物学研究:分析犬科动物大型超肉食性演化对支系多样化和灭绝风险的影响
  • 古生物食性与体型演化分析:利用物种体型、食性数据探究犬科动物生态特化的演化代价
  • 灭绝风险因素研究:验证体型、食性等特征与物种灭绝风险的关联,特别是更新世末期人类活动的影响
  • 演化模型验证:通过PyRATES代码复现犬科动物支系速率变化及生存分析结果,支持宏演化模型构建
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 584.62 MiB
最后更新 2026年1月28日
创建于 2026年1月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。