数据集概述
本数据集为潜水减压病(DCS)相关研究的补充数据,通过RNA测序分析DCS患者与健康潜水者的外周血转录组差异,探究DCS的炎症病理生理与免疫反应机制,包含基因表达、差异基因分析等多类型文件。
文件详解
- 说明文档:
- PACE_DATASET_Readme.txt: TXT格式,包含数据集标题、作者信息等基础说明。
- 基因表达数据文件:
- AllSamples.GeneExpression.FPKM.xls: XLS格式,记录所有样本的基因表达FPKM值。
- 差异基因分析文件(XLS格式):
- Control1-VS-Cases1.DEseq2_Method.GeneDiffExp.xls: 对照组1与病例组1的差异基因表达数据。
- Control1-VS-Cases1.DEseq2_Method.GeneDiffExpFilter.xls: 对照组1与病例组1的过滤后差异基因表达数据。
- Control1-VS-Control2.DEseq2_Method.GeneDiffExp.xls: 对照组1与对照组2的差异基因表达数据。
- Control2-VS-Cases2.DEseq2_Method.GeneDiffExp.xls: 对照组2与病例组2的差异基因表达数据。
- Control2-VS-Cases2.DEseq2_Method.GeneDiffExpFilter.xls: 对照组2与病例组2的过滤后差异基因表达数据。
- Cases1-VS-Cases2.DEseq2_Method.GeneDiffExp.xls: 病例组1与病例组2的差异基因表达数据。
- 可视化文件:
- DEG_number_barplot.pdf: PDF格式,差异基因数量的条形图。
适用场景
- 潜水医学研究: 分析减压病的炎症病理生理机制。
- 分子免疫学研究: 探究减压病相关的先天免疫激活与炎症反应通路。
- 转录组学分析: 研究潜水相关的基因表达变化及恢复过程。
- 减压病治疗靶点开发: 基于差异基因筛选潜在的治疗干预靶点。