数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了QL16品系ins-26(tm1983)基因突变体在食物环境中的行为实验数据。实验于2012年10月开展,通过tierpsy软件追踪线虫行为,包含原始视频处理结果、特征数据及标准化格式文件,用于研究ins-26基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:ins-26 (tm1983) on food L_2012_10_04__10_40_5565.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始处理数据,如26546个分割骨架信息、每帧像素对应的微米尺度(4.17406)等基础视觉数据
- 特征数据文件
- 文件名称:ins-26 (tm1983) on food L_2012_10_04__10_40_5565_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,对应实验的行为学量化指标
- 标准化格式文件
- 文件名称:ins-26 (tm1983) on food L_2012_10_04__10_40_5565.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准化格式存储的线虫行为数据压缩包,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析ins-26(tm1983)基因突变对秀丽隐杆线虫觅食行为的影响
- 模式生物行为学分析: 基于26546个分割骨架数据研究线虫在食物环境中的运动模式、轨迹特征
- 行为追踪技术验证: 评估tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为量化中的准确性与可靠性
- 神经生物学机制探索: 结合ins-26基因功能,探究调控线虫食物相关行为的神经分子机制
- 实验方法标准化研究: 参考E. Yemini等人的实验方法,优化秀丽隐杆线虫行为实验的标准化流程