数据集概述
本数据集包含大鼠中线液压冲击损伤或假手术对照后,海马体和下丘脑组织中促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)与糖皮质激素受体(GR)的定量实时PCR检测数据。样本来自雌雄大鼠,损伤后7天采集组织,数据经标准化处理,共5个文件。
文件详解
- 元数据文档
- 文件名称:Metadata_CRH_GR_7_DPI_2020.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含实验设计、样本信息、检测方法等元数据内容
- CRH海马体数据文件
- 文件名称:CRH_Hippocampus.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含ID、Treatment(处理方式)、Sex(性别)、Raw_CT1_CRH(CRH原始CT值1)、Raw_CT2_CRH(CRH原始CT值2)、Raw_CT3_CRH(CRH原始CT值3)、Raw_CT1_18s_rRNA(18s rRNA原始CT值1)、Raw_CT2_18s_rRNA(18s rRNA原始CT值2)、Raw_CT3_18s_rRNA(18s rRNA原始CT值3)、dCT1(dCT值1)、dCT2(dCT值2)、dCT3(dCT值3)、CT_Mean_CRH(CRH平均CT值)、CT_Mean_18s_rRNA(18s rRNA平均CT值)、dCT_Mean(平均dCT值)、ddCT、Fold_Change(表达倍数变化)
- GR下丘脑数据文件
- 文件名称:GR_Hypothalamus.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含ID、Treatment(处理方式)、Sex(性别)、Raw_CT1_GR(GR原始CT值1)、Raw_CT2_GR(GR原始CT值2)、Raw_CT3_GR(GR原始CT值3)、Raw_CT1_18s_rRNA(18s rRNA原始CT值1)、Raw_CT2_18s_rRNA(18s rRNA原始CT值2)、Raw_CT3_18s_rRNA(18s rRNA原始CT值3)、dCT1(dCT值1)、dCT2(dCT值2)、dCT3(dCT值3)、CT_Mean_GR(GR平均CT值)、CT_Mean_18s_rRNA(18s rRNA平均CT值)、dCT_Mean(平均dCT值)、ddCT、Fold_Change(表达倍数变化)
- GR海马体数据文件
- 文件名称:GR_Hippocampus.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:推测包含ID、Treatment、Sex及GR基因在海马体中的原始CT值、18s rRNA内参CT值、dCT值、平均CT值、ddCT、表达倍数变化等字段
- CRH下丘脑数据文件
- 文件名称:CRH_Hypothalamus.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:推测包含ID、Treatment、Sex及CRH基因在下丘脑中的原始CT值、18s rRNA内参CT值、dCT值、平均CT值、ddCT、表达倍数变化等字段
适用场景
- 脑损伤分子机制研究: 分析CRH与GR基因在脑损伤后的表达变化,探究神经内分泌通路响应机制
- 性别差异研究: 比较雌雄大鼠在脑损伤后CRH与GR基因表达的性别特异性差异
- 神经科学实验设计参考: 为定量PCR检测脑损伤相关基因表达提供标准化实验设计模板
- 基因表达数据分析方法验证: 基于原始CT值与标准化后的dCT、ddCT值,验证基因表达定量分析方法的可靠性