"英文标题:Global Edible Fermented Bacteria Germplasm Genetic Characteristics Database
数据集概述
存储全球食用发酵菌种质资源的核心遗传特征参数,涵盖酵母菌、乳酸菌、霉菌等食用发酵生产中的关键菌株。
数据按菌种分类层级组织,覆盖全球主要菌种保藏机构的资源信息,包含多种食用发酵菌的遗传标记、代谢通路、抗逆性相关基因等参数。颗粒度精确至菌株个体层级,支持不同菌株间的遗传差异比对与功能特性关联分析。数据结构遵循微生物遗传学领域标准格式,参数定义基于国际通用的分子生物学检测方法。
该数据集是食用发酵菌种质资源开发利用的基础支撑。食用发酵菌的遗传特征直接决定其发酵性能、产物风味及工业适用性,明确遗传参数对于选育高产优质菌株、优化发酵工艺、保障发酵制品质量均具有核心作用。多菌株的遗传特征集合还可用于构建食用发酵菌的系统发育树,揭示菌株间的演化关系与功能分化规律。
字段详情
数据集包含以下核心字段:
strain_id:菌株编号,由菌种保藏机构统一分配,唯一标识特定菌株
genus_species:菌种分类,采用双名法命名,包含属名和种名
genetic_marker:遗传标记,指用于菌株鉴定与分型的DNA片段,如ITS序列
metabolic_gene:代谢相关基因,指编码发酵代谢关键酶的基因,如淀粉酶基因
stress_tolerance_param:抗逆性参数,指菌株对温度、pH等环境胁迫的耐受阈值,无量纲(通过标准化评分表示)
collection_institute:保藏机构,指保存该菌株的专业菌种保藏组织
适用场景
- 发酵制品企业筛选具有高产风味物质潜力的菌株,优化发酵生产工艺
- 微生物遗传学研究人员构建食用发酵菌系统发育树,解析菌株演化关系
- 食品质量监管部门验证发酵制品中使用菌株的遗传安全性与合规性
- 菌种保藏机构完善食用发酵菌种质资源的遗传信息档案
- 生物工程公司开发基因编辑改造的工业用优质发酵菌株"