数据集概述
本数据集为圈养低地貘鸟分枝杆菌亚种人型菌株比较基因组学研究的补充材料，包含基因分析表格、测序质量数据、基因组图谱等文件，支持该研究的基因组特征与进化关系分析。
文件详解
- 数据表格文件（CSV格式，6个）：
- 00_MAH_from_tapirs_in_Germany_data_overview.CSV：数据概述表
- 02_Supplementary_table_2_virulence_genes.csv：毒力基因表
- 03_Supplementary_table_3_Insertion_elements.csv：插入元件表
- 04_Supplementary_table_4_foreign_strains.CSV：外源菌株分析表（含菌株信息、测序质量等字段）
- 09_Supplementary_table_5_Sequencing quality raw data.csv：原始测序质量数据表
- 图表文件（JPEG格式，4个）：
- 05_Supplementary_figure_1_recF_alignment.jpeg：recF基因比对图
- 06_Supplementary_figure 2_cgMLST_MST_all_analyzed_strains.jpeg：cgMLST最小生成树图
- 07_Supplementary_figure_3_tanglegrams.jpeg：系统发育缠结图
- 08_Supplementary_figure_4_complete_pangenome.jpeg：全泛基因组图
- 文档文件（PDF格式，1个）：
- 01_Supplementary_table_1_antimicrobial_resistance_genes.pdf： antimicrobial resistance基因表
适用场景
- 分枝杆菌基因组学研究：分析菌株基因特征与进化关系
- 动物传染病学研究：探究圈养低地貘分枝杆菌感染机制
- 分子生物学实验：辅助毒力基因、插入元件等功能分析
- 基因组测序质量评估：验证原始测序数据可靠性
- 比较基因组学分析：支撑泛基因组、cgMLST等多维度研究
