数据集概述
本数据集整合多位点系统地理学、气候生态位模型(ENMs)及多变量统计方法,探究末次第四纪气候变化对加州白栎(Quercus lobata Née)当代遗传变异的影响。数据包含DNA序列、生态位模型结果及微卫星标记信息,可用于分析过去气候对该物种遗传结构、多样性及分布的作用,共含4个文件。
文件详解
- DNA序列文件(TXT格式)
- 文件名称:Qlobata_ef1a_forDryad.txt、Qlobata_g3pdh_forDryad.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:以NEXUS格式存储DNA序列数据,包含DIMENSIONS(样本数、序列长度)、FORMAT(数据类型为DNA,缺失值标识为N,间隔符为-)及MATRIX(样本ID与对应DNA序列)等字段。
- 生态位模型结果文件(XLSX格式)
- 文件名称:Gugger_etal ENM forDryad.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录加州白栎末次间冰期至现代的生态位模型分析结果,包含气候变量、分布区稳定性及生态位分化等数据。
- 微卫星标记数据文件(XLSX格式)
- 文件名称:Gugger_etal SSR forDryad.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:存储核微卫星(SSR)标记数据,包含样本遗传多样性指标、种群遗传结构及分化时间等分析结果。
数据来源
论文“Influence of late Quaternary climate change on present patterns of genetic variation in valley oak, Quercus lobata Née”
适用场景
- 植物种群遗传学研究: 分析加州白栎种群遗传结构、多样性及分化时间,探究末次第四纪气候对其的影响。
- 生态位模型验证: 利用ENM结果验证气候变量与物种分布的关系,评估分布区稳定性。
- 遗传变异驱动因素分析: 通过多变量统计方法,解析过去与当前气候、地理因素对遗传变异的相对贡献。
- 气候变化生态学研究: 探究末次第四纪冰川循环对北美西部植物遗传格局的塑造作用。