数据集概述
本数据集围绕墨西哥高山栎（Quercus rugosa）种群的气候适应性遗传变异展开，通过基因分型测序获取17个采样点103个个体的5354个单核苷酸多态性（SNPs）数据，结合梯度森林模型分析遗传变异与气候因子的关联，识别气候适应相关基因位点，为该物种的气候适应研究及保护管理提供数据支持。
文件详解
- gradient_forests.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含梯度森林（Gradient Forest）模型相关数据，用于分析等位基因频率沿环境梯度的变化，预测气候变化敏感区域
- FinalMAF01_Pruned103_5354.vcf
- 文件格式：VCF
- 内容说明：经过质量过滤（最小等位基因频率0.01）的基因型数据文件，包含103个个体的5354个SNPs位点信息，记录样本基因型、等位基因频率等遗传数据
数据来源
标题为“Landscape genomics provides evidence of climate-associated genetic variation in Mexican populations of Quercus rugosa Nee”的研究
适用场景
- 森林树种气候适应性研究：分析Quercus rugosa种群遗传变异与气候因子的关联，识别气候适应相关基因位点
- 气候变化风险评估：利用梯度森林模型预测未来气候情景下该物种的适应性错配区域，评估气候变化对种群的影响
- 森林恢复与管理策略制定：基于遗传适应性数据，为墨西哥高山栎林的保护、恢复及可持续管理提供科学依据
- 景观基因组学方法应用：作为景观基因组学研究的案例数据，支持相关分析方法的验证与推广
