数据集概述
本数据集为doi:10.1101/2023.10.12.562063论文配套数据，聚焦R1441C-LRRK2突变对髓系免疫细胞耗竭的年龄和性别依赖性影响。包含基因表达差异分析（DEG）、蛋白质分析、病原体摄取实验、流式细胞术数据等50个文件，覆盖CSV、pzfx、prism、xlsx四种格式，核心为基因表达和免疫功能相关数据。
文件详解
- CSV文件（32个，占比64.0%）
- 文件示例：DEG 22km52_pMacs_res_R1441CvsWT.in.F_Y_UT.csv、DEG 22km52_pMacs_res_R1441CvsWT.in.M_O_IFN.csv
- 字段映射：包含GeneStableID（基因稳定ID）、symbol（基因符号）、entrezid（Entrez基因ID）、avg.fpkm（平均FPKM值）、fpkm.WT_（野生型样本FPKM值）、fpkm.R1441C_（突变型样本FPKM值）等字段，覆盖不同性别（F/M）、年龄（Y/O）、处理条件（UT/IFN）的样本数据
- pzfx文件（11个，占比22.0%）
- 文件示例：aged male pathogen uptake.pzfx、young female tunel staining.pzfx
- 内容说明：病原体摄取实验、TUNEL染色等实验数据文件
- prism文件（6个，占比12.0%）
- 文件示例：LRRK2 protein analysis.prism、male data pmacs flow.prism
- 内容说明：LRRK2蛋白质分析、巨噬细胞（pMacs）流式细胞术等数据文件
- xlsx文件（1个，占比2.0%）
- 文件名称：RNA RIN AND QC SUMMARY_.xlsx
- 内容说明：RNA完整性（RIN）和质量控制（QC）汇总数据
数据来源
doi:10.1101/2023.10.12.562063论文
适用场景
- 基因突变功能研究：分析R1441C-LRRK2突变对髓系免疫细胞基因表达谱的影响
- 免疫细胞耗竭机制分析：探究年龄和性别因素在R1441C-LRRK2突变诱导免疫细胞耗竭中的作用
- 基因表达差异分析：对比野生型与突变型样本在不同处理条件下的差异表达基因
- 生物标志物筛选：基于基因表达数据筛选R1441C-LRRK2突变相关的免疫功能标志物
- 蛋白质功能研究：结合LRRK2 protein analysis.prism数据分析突变对LRRK2蛋白功能的影响
