染色体间接触特性活细胞成像与Hi_C数据集

数据集概述

本数据集聚焦染色体间接触特性,包含活细胞成像(CLING技术)的原始z-stack图像文件、空间距离测量数据、4D-CLING成像的速度测量数据,以及小鼠胚胎干细胞和人类RPE-1细胞的Hi-C矩阵数据,为研究染色体空间结构与动态提供多维度支持。

文件详解

  • 活细胞成像数据文件(.zip格式):共14个,以日期命名(如2015_11_26_GAPDH+CISTR-ACT_13.zip),包含CLING技术获取的原始z-stack图像或处理后图像
  • Hi-C矩阵与注释文件(.gz格式):共5个,包括RPE1_250000_iced_dense.matrix.gz、mESC_250000_iced_dense.matrix.gz等Hi-C矩阵文件,以及RPE1_40000_abs.bed.gz注释文件
  • 测量数据文件(.xlsx格式):共2个,其中spatial_distances.xlsx记录两个基因座间的空间距离(单位:微米),speeds.xlsx记录4D-CLING成像的速度测量数据

适用场景

  • 染色体空间结构研究:分析不同细胞类型中染色体间的接触模式与动态变化
  • 活细胞成像技术验证:评估CLING技术在染色体成像中的分辨率与准确性
  • 基因组学数据分析:结合Hi-C矩阵探究染色体三维结构对基因表达的调控机制
  • 细胞生物学实验:研究染色体动态运动(如速度)与细胞功能的关联
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 544.8 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
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