数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1226品系(acr-18(ok1285)V基因突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于分析该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:acr-18 (ok1205) on food R_2010_02_24__12_02_5569.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始追踪数据,对应899.223秒的记录时长,帧率25.641帧/秒,像素分辨率4.33523微米/像素,含19681个分割骨架数据
- 特征提取文件
- 文件名称:acr-18 (ok1205) on food R_2010_02_24__12_02_5569_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等行为学特征
- 标准化格式文件
- 文件名称:acr-18 (ok1205) on food R_2010_02_24__12_02_5569.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为符合WCON标准的线虫行为数据文件,用于跨平台数据共享与分析
数据来源
C. elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因突变体行为表型研究:分析acr-18基因缺失对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学机制研究:探究acr-18基因(编码乙酰胆碱受体)在调控线虫行为中的作用
- 行为实验标准化方法验证:基于E. Yemini等的实验方法,验证线虫行为学实验的可重复性
- 生物信息学工具应用:测试tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取效果与数据处理能力