数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1374品系ocr-3(ok1559)基因线虫的行为实验数据。实验于2010年4月开展,通过tierpsy软件追踪线虫在NGM琼脂培养基上的行为,包含视频分析后的特征数据和运动轨迹等文件,用于研究该基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:ocr-3 (a1537) on food L_2010_04_22__11_48_1248.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含视频帧对应的线虫位置、骨架等基础信息
- 文件名称:ocr-3 (a1537) on food L_2010_04_22__11_48_1248.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含wcon格式的线虫运动轨迹数据,记录线虫在实验过程中的动态行为序列
- 文件名称:ocr-3 (a1537) on food L_2010_04_22__11_48_1248_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、身体弯曲度等量化指标
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析ocr-3(ok1559)基因突变对线虫运动行为的影响
- 模式生物行为学分析:基于追踪数据研究线虫在特定培养基上的行为模式和运动特征
- 生物图像分析算法验证:用于验证tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取准确性
- 神经生物学研究:结合基因背景探究线虫行为调控的神经机制