数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫RB1546品系(tmc-1基因ok1859等位基因突变体)的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包括运动轨迹、骨架分割等量化数据,实验由MRC分子生物学实验室完成,采用Tierpsy软件追踪分析。
文件详解
- 行为特征文件:RB1546 ON FOOD l_2011_02_08__10_58_35__1_features.hdf5,格式HDF5,存储线虫行为特征数据
- 压缩行为数据文件:RB1546 ON FOOD l_2011_02_08__10_58_35__1.wcon.zip,格式ZIP,包含wcon格式的行为记录压缩包
- 原始追踪数据文件:RB1546 ON FOOD l_2011_02_08__10_58_35__1.hdf5,格式HDF5,存储原始追踪的线虫骨架及运动参数
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫感官基因功能研究:分析tmc-1基因缺失对秀丽隐杆线虫摄食、运动等行为的影响
- 神经行为学表型分析:基于骨架分割和运动参数,量化基因突变体的行为模式差异
- 模式生物行为数据库补充:为线虫行为数据库提供标准化的基因敲除株行为数据
- 行为追踪算法验证:用于测试和优化Tierpsy等线虫行为追踪软件的准确性和稳定性