数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2011年2月8日开展的RB1816品系(gpa-16(ok2349)I基因突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验遵循特定培养和记录协议,使用tierpsy软件采集并生成特征文件、wcon压缩文件等,包含线虫运动轨迹、时间序列等行为相关数据。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:
gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__12_36___3___6_features.hdf5、gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__12_36___3___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,涉及17689个分割骨架的运动参数,对应视频帧率20.0帧/秒、总时长899.3秒、像素分辨率4.57016微米/像素等实验参数
- 行为数据压缩文件(.zip格式)
- 文件名称:
gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__12_36___3___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的wcon格式压缩文件,用于存储标准化的行为时间序列数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变体行为表型分析: 研究gpa-16基因对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学机制研究: 结合基因信息分析gpa-16基因调控线虫行为的分子机制
- 行为实验标准化方法验证: 基于既定实验协议,验证线虫行为实验的可重复性
- 模式生物行为数据挖掘: 作为线虫行为数据库的一部分,支持大规模行为数据的交叉对比研究