数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB1816品系(携带gpa-16(ok2349)I突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的运动行为,包含实验条件、视频参数及分析得到的行为特征数据,共3个文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:gpa-16 (ok2349)I on food R_2009_06_12__12_28_52__10.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始或核心观测数据,具体字段未明确说明。
- 特征数据文件
- 文件名称:gpa-16 (ok2349)I on food R_2009_06_12__12_28_52__10_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含由tierpsy软件分析得到的线虫行为特征数据,具体字段未明确说明。
- 压缩数据文件
- 文件名称:gpa-16 (ok2349)I on food R_2009_06_12__12_28_52__10.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,格式为wcon(线虫行为数据标准格式),具体内容未明确说明。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析gpa-16基因对秀丽隐杆线虫运动行为的影响。
- 生物行为学实验分析:基于视频参数和行为特征数据,研究线虫在食物环境中的行为模式。
- 实验方法验证:参考实验方案(E. Yemini et al.方法),验证线虫行为观测实验的可重复性。
- 行为数据分析工具应用:基于tierpsy软件分析结果,探索线虫行为特征的提取与解读方法。