数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1958菌株(npr-20(ok2575)II)的行为实验数据。实验于2011年9月开展,通过视频追踪分析成年雌雄同体线虫在特定培养基上的行为特征,包含原始追踪数据、标准化格式数据及特征提取结果,共3个文件。
文件详解
- 行为追踪数据文件:
T07D4.1 (ok2575)II on food R_2011_09_13__15_59_31___2___10.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含26576个分割骨架信息,对应实验总时长899秒、帧率30.03帧/秒的视频数据
- 标准化行为数据文件:
T07D4.1 (ok2575)II on food R_2011_09_13__15_59_31___2___10.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为标准化行为数据文件,遵循线虫行为数据交换格式规范
- 行为特征数据文件:
T07D4.1 (ok2575)II on food R_2011_09_13__15_59_31___2___10_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储从视频中提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析npr-20基因对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 行为学实验方法验证:验证基于tierpsy软件的线虫行为追踪与特征提取方法的有效性
- 神经生物学机制探索:研究线虫行为与神经调控通路的关联
- 模式生物实验标准化:为秀丽隐杆线虫行为实验提供标准化数据格式参考