数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB1958品系(基因型npr-20(ok2575)II)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的行为,包含视频追踪数据、特征提取结果等,用于研究该基因型线虫的行为特征。
文件详解
- 文件1:
T07D4.1 (ok2575)II on food R_2011_09_06__15_53_04___8___7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含26687个分割骨架数据,对应约900秒、每秒30.03帧的视频记录,像素分辨率为每像素5.06577微米
- 文件2:
T07D4.1 (ok2575)II on food R_2011_09_06__15_53_04___8___7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含WCONTROL格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为标准格式数据,用于跨平台的行为数据交换与解析
- 文件3:
T07D4.1 (ok2575)II on food R_2011_09_06__15_53_04___8___7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等量化特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为学研究: 分析npr-20基因缺失对线虫食物趋向、运动模式等行为的影响
- 基因型-表型关联分析: 探究npr-20(ok2575)突变体的行为表型特征
- 行为实验方法验证: 基于E. Yemini等建立的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 生物图像特征提取算法测试: 利用标注的骨架数据测试或优化线虫行为特征提取算法