数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB2059 ins-28(ok2722)I基因敲除株的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,采用tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的行为,包含视频衍生的运动特征数据、骨架分割信息等,支持线虫基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:
ins-28 (ok2722)I on food L_2011_05_19__11_04_18___6___1.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的标准化数据,可能涵盖时间序列运动参数、坐标信息等结构化行为记录
- 主行为数据文件
- 文件名称:
ins-28 (ok2722)I on food L_2011_05_19__11_04_18___6___1.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,包括视频帧对应的线虫位置、运动状态等原始追踪信息,关联26818个分割骨架数据
- 特征提取数据文件
- 文件名称:
ins-28 (ok2722)I on food L_2011_05_19__11_04_18___6___1_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从视频中提取的行为特征数据,基于每秒30.03帧的采样频率、4.52262微米/像素的分辨率计算,覆盖899秒实验时长内的运动特征参数
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ins-28基因敲除对秀丽隐杆线虫行为表型的影响,探索基因与行为的关联机制
- 模式生物行为学分析: 基于标准化行为数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、节律等行为特征
- 生物图像特征提取验证: 验证tierpsy软件在模式生物行为追踪中的特征提取精度与可靠性
- 实验室行为实验复现: 为同类线虫行为实验提供标准化数据参考,支持实验方法与结果的复现分析