数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB2188品系(flp-20(ok2964)X基因突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基上进行,包含视频追踪数据及处理后的行为特征数据,可用于研究flp-20基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为追踪数据文件
- 文件名称:flp-20 (ok2964)X on food R_2010_01_19__10_23_1661.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含18878个分段骨架信息,关联视频像素与实际长度(4.64175微米/像素)
- 行为特征数据文件
- 文件名称:flp-20 (ok2964)X on food R_2010_01_19__10_23_1661_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件处理后的行为特征数据,涵盖线虫运动、姿态等量化指标
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:flp-20 (ok2964)X on food R_2010_01_19__10_23_1661.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,遵循wcon格式标准
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经生物学研究: 分析flp-20基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 基因突变体行为表型分析: 对比野生型与flp-20(ok2964)X突变体的行为差异,挖掘基因功能
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 生物行为数据标准化研究: 利用wcon格式数据探索线虫行为数据的标准化存储与共享模式