数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB680品系(asic-1基因ok415突变体)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据,包含视频追踪的原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于分析该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:asic-1 (ok415) on food R_2010_07_08__11_44_1925.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含视频帧对应的线虫位置、姿态等基础信息
- 特征提取文件
- 文件名称:asic-1 (ok415) on food R_2010_07_08__11_44_1925_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、速度、身体弯曲度等分析指标
- 标准化格式文件
- 文件名称:asic-1 (ok415) on food R_2010_07_08__11_44_1925.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:以标准化wcon格式存储的线虫行为数据,便于跨平台数据共享与整合
数据来源
C. elegans behavioural database
适用场景
- 基因功能研究: 分析asic-1基因ok415突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 线虫行为学分析: 基于视频追踪数据研究线虫在特定培养基上的觅食、运动模式
- 行为特征提取算法验证: 对比不同工具提取的线虫行为特征一致性
- 模式生物实验标准化: 参考本实验的protocol与数据格式,建立统一的秀丽隐杆线虫行为实验规范