数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB777品系(hcf-1(ok559)IV基因突变)的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为表现,包含视频追踪数据及特征提取结果,属于线虫行为数据库的一部分。
文件详解
- 文件1:hcf-1 (ok559)IV on food R_2011_08_11__11_44_47__6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始追踪数据,如骨架分割信息、时间序列坐标等基础行为数据
- 文件2:hcf-1 (ok559)IV on food R_2011_08_11__11_44_47__6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为符合wcon标准的线虫行为数据文件,记录行为轨迹的标准化格式数据
- 文件3:hcf-1 (ok559)IV on food R_2011_08_11__11_44_47__6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如运动速度、弯曲频率等量化分析指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析hcf-1基因变异对RB777品系线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析: 基于标准化实验数据研究线虫在食物环境中的运动、觅食等行为模式
- 生物信息学特征提取验证: 验证tierpsy软件提取的线虫行为特征与基因表型的关联性
- 神经生物学机制探究: 结合基因背景研究线虫行为背后的分子与神经调控机制