数据集概述
本数据集包含1143个自由基反应的原子映射SMILES、势垒高度、反应能及反应机理生成器（RMG）反应模板，以CSV文件存储。同时提供Q-Chem和Molpro计算输出文件，用于补充RDB7数据集，支持化学反应机理研究与计算验证。
文件详解
- 数据文件（CSV）
- 文件名称：wb97xd3_rad.csv、ccsdtf12_rad.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含idx（反应索引）、rsmi（反应物SMILES）、psmi（产物SMILES）、rinchi（反应物InChI）、pinchi（产物InChI）、dE0（反应能）、dH0（焓变）、RMG_family（RMG反应模板）
- 计算输出压缩包（TAR.GZ）
- 文件名称：wb97xd3_rad.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ
- 内容说明：ωB97X-D3/def2-TZVP水平的Q-Chem几何优化与振动分析输出文件，含反应物、过渡态及产物结构数据
- 计算输出压缩包（TAR.GZ）
- 文件名称：ccsdtf12_rad.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ
- 内容说明：CCSD(T)-F12/cc-pVDZ-F12水平的Molpro单点能计算输出文件
- 验证计算压缩包（ZIP）
- 文件名称：uccsdtf12.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：2个反应的UCCSD(T)-F12/cc-pVDZ-F12单点能计算输出文件，用于方法验证
数据来源
Grambow's repository（10.5281/zenodo.3731554）、Spiekermann's repository（10.5281/zenodo.6618262）
适用场景
- 化学反应机理研究: 利用原子映射SMILES和RMG模板分析自由基反应路径与机理
- 计算化学方法验证: 通过不同理论水平（DFT、CCSD(T)-F12）的计算结果对比，验证计算方法准确性
- 反应数据库扩充: 补充RDB7数据集，丰富自由基反应的热力学与动力学数据
- 产物结构分析: 基于分离的产物几何结构，研究自由基反应产物的稳定性与构象特征
