人类肠道噬菌体携带孢子形成基因数据集

数据集概述

本数据集围绕人类肠道噬菌体携带的孢子形成基因展开,通过挖掘基因组和肠道宏基因组,识别出噬菌体编码的与细菌孢子形成相关的基因(如spo0A等转录因子、染色体分区及DNA修复相关基因),为研究噬菌体对肠道细菌孢子形成的调控机制提供数据支持。

文件详解

  • README.md:Markdown格式文档,包含数据集基本说明、文件目录结构及各压缩包内容概述
  • README.html:HTML格式文档,内容与README.md一致,便于网页端查看
  • diverse_ecosystems_sporulation_genes.tar.gz:压缩包文件,可能包含不同生态系统中孢子形成基因相关数据
  • dram_output_guts.tar.gz:压缩包文件,包含肠道来源未培养病毒基因组(UViGs)的DRAM-v功能注释结果
  • gut_sporulation_genes.tar.gz:压缩包文件,包含肠道噬菌体孢子形成基因的核心数据集
  • manual_curation.tar.gz:压缩包文件,包含人工审核与校正后的孢子形成基因注释数据
  • spore_amg-main.zip:压缩包文件,可能包含与孢子形成相关的辅助代谢基因(AMG)分析数据

适用场景

  • 肠道微生物学研究:分析噬菌体对肠道产芽孢细菌孢子形成的调控机制
  • 噬菌体-细菌互作研究:探究噬菌体编码的孢子形成基因对细菌生命周期的影响
  • 宏基因组数据分析:挖掘不同生态系统中噬菌体携带的孢子形成相关基因分布
  • 肠道健康研究:评估噬菌体调控细菌孢子形成对人体肠道微生态平衡的作用
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 703.45 MiB
最后更新 2025年12月18日
创建于 2025年12月18日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。