数据集概述
本数据集是研究论文“Human genetic variation reveals FCRL3 is a lymphocyte receptor for Yersinia pestis”的配套数据,包含鼠疫耶尔森菌入侵宿主细胞相关的基因关联分析、蛋白功能验证及显微镜观察等实验数据,支持FCRL3作为该菌淋巴细胞受体的研究结论。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件,具体说明如下:
- 说明文件:
- readme.txt:提供数据集的基本说明,包含Western Blot实验条带的样本信息。
- 实验结果文件(按图表分类):
- 图2相关文件(Keener et al. Figure 2/目录):包含Western Blot结果(如2C_FCRL3&TUBULIN_WB.tif)、ICE实验结果压缩包(如2E_ICE_Results_FCRL3.zip)及显微镜图像(Keener et al. 2D F1 Microscopy/目录下的.tiff文件)。
- 图3相关文件(Keener et al. Figure 3/目录):包含聚类显微镜图像(Keener et al. 3 Clustering Microscopy/目录下的.TIF文件)。
- 图4相关文件(Keener et al. Figure 4/目录):包含Western Blot结果(如4B_Flag_WB.tif、4C&5C_Tubulin_WB.tif)。
- 图5相关文件(Keener et al. Figure 5/目录):包含Western Blot结果(如5A_MYC_WB.tif、5B_flag_WB.tif)。
- 图6相关文件(Keener et al. Figure 6/目录):包含Western Blot结果(如6C_avitag_WB.tif)。
- 补充图S3B相关文件(Keener et al. S3B LAMP1 Microscopy/目录):包含LAMP1显微镜观察图像(如s3B_63x_uninfected_fcrl3oe_lamp1_13_w1CF 555nm mCherry.TIF)。
- 文件格式:以.tif、.tiff图像文件为主,辅以.zip压缩包、.txt说明文件及.ini配置文件。
数据来源
杜克数据仓库(Duke Data Repository),相关GWAS汇总统计数据DOI为10.7924/r43n2d008
适用场景
- 医学微生物学研究:分析鼠疫耶尔森菌入侵宿主细胞的分子机制。
- 免疫学研究:探究FCRL家族蛋白在细菌感染中的作用及免疫受体功能。
- 遗传学研究:验证FCRL3基因变异与鼠疫耶尔森菌感染的关联。
- 传染病机制研究:揭示病原体利用宿主免疫受体建立感染的策略。