数据集概述
本数据集包含人足月胎盘CDX2阳性细胞与H9胚胎干细胞、胎盘CDX2阴性细胞的批量RNA测序（Bulk RNA seq）分析数据，涉及原始及标准化基因表达量等多种转录组数据文件，为研究CDX2细胞特性及心血管再生机制提供支持。
文件详解
数据集包含两个核心目录的文件，具体说明如下：
- CDX2 vs Neg Mendely目录文件（胎盘CDX2阳性与阴性细胞对比）：
- CDX2 and mCherry neg raw_counts.csv：CSV格式，含Neg1-Neg4（阴性样本）、Pos1-Pos4（阳性样本）的基因原始计数
- CDX2 and mCherry neg rlog_transformed_counts.csv：CSV格式，经rlog转换的基因表达量数据
- CDX2 and mCherry negTPM_values.csv：CSV格式，基因转录本每百万读数（TPM）标准化数据
- CDX2 and mCherry neg normalized_counts.csv：CSV格式，标准化基因计数数据
- Differential_expression_analysis_table.csv：CSV格式，差异表达分析结果表
- CDX2 and mCherry neg differential_splice_variant_expression.zip：ZIP格式，可变剪接变异表达分析数据
- CDX2 vs H9ES Mendely目录文件（胎盘CDX2细胞与H9胚胎干细胞对比）：
- CDX2 vs H9ES normalized_counts.csv_20210813112101.csv：CSV格式，标准化基因计数数据
- CDX2 and H9ES raw_counts.csv_20210813172258.csv：CSV格式，基因原始计数数据
- CDX2 ans H9ES TPM_values.csv_20210813172347.csv：CSV格式，TPM标准化数据
- summary_mapping_stats.csv_20210813173503.csv：CSV格式，测序数据比对统计摘要
- SignificantDEGs versus H9 ES.csv_20210813171348.xls：XLS格式，与H9胚胎干细胞的显著差异表达基因表
- HL9-A.transcript.gtf.combined.gtf_20210813172527.gtf.txt：TXT格式，转录本注释文件（含基因ID、转录本ID等信息）
适用场景
- 干细胞生物学研究：分析胎盘CDX2细胞与胚胎干细胞的基因表达差异，探究其发育保守特性
- 心血管再生机制研究：挖掘CDX2细胞参与心血管再生的关键基因及信号通路
- 转录组数据分析方法验证：用于RNA测序数据标准化、差异表达分析等方法的验证与比较
- 胎盘细胞功能研究：揭示足月胎盘CDX2阳性/阴性细胞的转录组特征及功能差异
