数据集概述
本数据集为论文“Rhizosphere bacterial community composition depends on plant diversity legacy in soil and plant species identity”的补充信息，包含根际细菌群落研究的样本注释、引物序列、OTU分类注释与序列计数、差异丰度分析结果、门水平统计及富集分析等8个文件，支撑植物物种身份与土壤遗留效应对根际细菌群落组成影响的研究。
文件详解
- Supplemental_Table_1.csv（CSV格式）：样本测序分析注释表，包含plant history（植物历史）、soil type（土壤类型）、species（物种）等字段
- Supplemental_Table_2.csv（CSV格式）：研究中使用的所有引物序列表，包含sampleID（样本ID）、forwardprimer（正向引物）、reverseprimer（反向引物）字段
- Supplemental_Table_3.zip（ZIP格式）：操作分类单元（OTU）的分类注释表压缩包
- Supplemental_Table_4.zip（ZIP格式）：操作分类单元（OTU）的序列计数表压缩包
- Supplemental_Table_5.xlsx（XLSX格式）：差异丰度OTU统计及对比分析表，含各对比组的logBaseMean、logFC、P值、调整后P值等字段
- Supplemental_Table_6.csv（CSV格式）：各细菌门注释的OTU数量统计表
- Supplemental_Table_7.csv（CSV格式）：单作与混作土壤中丰度增加OTU的门水平富集/耗竭检验表，含Total counts、Observed、Expected等字段
- Supplemental_File_1.zip（ZIP格式）：研究中鉴定的10205条OTU序列的fasta文件压缩包
数据来源
论文“Rhizosphere bacterial community composition depends on plant diversity legacy in soil and plant species identity”
适用场景
- 根际微生物群落结构研究：分析植物物种身份与土壤遗留效应对根际细菌群落组成的影响
- 微生物差异丰度分析：利用OTU差异丰度数据探究不同处理下的细菌群落变化
- 细菌分类学研究：基于OTU分类注释与门水平统计开展微生物分类学分析
- 引物设计参考：通过引物序列表为相关微生物测序实验提供引物设计依据
- 土壤微生物生态学研究：结合土壤类型与植物历史数据，研究土壤-植物-微生物互作机制
