数据集概述
本数据集是基于日本马鲛鱼种群增殖项目遗传效应的案例研究数据,采用“前后对照影响”设计,对日本周边13个地点采集的1424条野生鱼和230条 hatchery鱼进行了基因分析,包含微卫星标记基因型数据和线粒体DNA D-loop区序列数据,用于研究增殖放流对野生种群的遗传影响。
文件详解
- 文件名称:JSM_haplotype_sequences.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含日本马鲛鱼线粒体DNA D-loop区单倍型序列,如>HAP1开头的碱基序列
- 文件名称:JSM_genotypes_and_GSI.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含5个微卫星标记的基因型数据及GSI(遗传来源识别)相关信息
- 文件名称:JSM_individual_sequences.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含日本马鲛鱼个体的DNA序列数据,为种群遗传分析提供基础序列信息
数据来源
论文“Genetic effects of marine stock enhancement: a case study based on the highly piscivorous Japanese Spanish mackerel”
适用场景
- 海洋渔业资源管理: 评估日本马鲛鱼种群增殖放流对野生种群遗传多样性的影响,为渔业资源可持续利用提供科学依据
- 种群遗传学研究: 分析日本马鲛鱼的种群结构、遗传多样性及有效种群大小,探究其遗传演化规律
- 水产养殖增殖效应评估: 研究hatchery鱼与野生鱼的遗传差异,评估增殖放流的遗传风险
- 分子生态学应用: 利用微卫星标记和线粒体DNA序列数据,开展日本马鲛鱼的种群识别、亲缘关系分析等研究