数据集概述
本数据集围绕东北太平洋热液喷口管虫Ridgeia piscesae的宿主与化学自养共生体氮代谢可塑性展开研究,包含氮浓度测定、基因表达分析、稳定同位素数据、DNA序列及qPCR实验细节等多维度数据,用于探究环境条件对共生体氮代谢的影响,共5个文件。
文件详解
- Dryad Table_Nitrate and ammonium concs.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含Ridgeia piscesae不同表型(LS和SF)个体血液中硝酸盐和铵盐的浓度数据,支持环境氮水平与宿主生理状态的关联分析
- gene expression of reference genes for normalization.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:记录用于基因表达定量分析的内参基因表达数据,为氮代谢相关基因的表达量标准化提供参考依据
- Figure 6 isotope data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含宿主鳃羽和共生体组织的稳定氮同位素比值数据,用于解析氮代谢途径的差异
- DNA sequences.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录Ridgeia piscesae宿主谷氨酰胺合成酶等关键氮代谢基因的部分cDNA序列,如glnA_host基因的核苷酸序列
- Details of qPCR assay.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:详细描述定量PCR实验的设计、引物信息及操作流程,确保基因表达数据的可重复性
数据来源
Dryad(关联研究主题:Characterizing the plasticity of nitrogen metabolism by the host and symbionts of the hydrothermal vent chemoautotrophic symbioses Ridgeia piscesae)
适用场景
- 深海共生体氮代谢机制研究: 分析热液喷口管虫共生体的硝酸盐还原、铵盐同化等代谢途径的环境响应特性
- 环境因子对生物代谢的调控分析: 探究温度、化学梯度等环境条件对共生体氮代谢基因表达的影响
- 海洋生物适应策略研究: 解析Ridgeia piscesae不同表型(LS和SF)在氮营养利用上的生态适应机制
- 分子生态学实验方法参考: 为深海生物基因表达定量(qPCR)、稳定同位素分析等实验提供方法学参考
- 共生关系代谢互作分析: 研究宿主与共生体在氮循环过程中的功能分工与协同机制