Ridgeia_piscesae_Source_深海热液喷口共生体氮代谢可塑性研究数据集

数据集概述

本数据集围绕东北太平洋热液喷口管虫Ridgeia piscesae的宿主与化学自养共生体氮代谢可塑性展开研究,包含氮浓度测定、基因表达分析、稳定同位素数据、DNA序列及qPCR实验细节等多维度数据,用于探究环境条件对共生体氮代谢的影响,共5个文件。

文件详解

  • Dryad Table_Nitrate and ammonium concs.xls
  • 文件格式:XLS
  • 字段映射介绍:包含Ridgeia piscesae不同表型(LS和SF)个体血液中硝酸盐和铵盐的浓度数据,支持环境氮水平与宿主生理状态的关联分析
  • gene expression of reference genes for normalization.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:记录用于基因表达定量分析的内参基因表达数据,为氮代谢相关基因的表达量标准化提供参考依据
  • Figure 6 isotope data.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含宿主鳃羽和共生体组织的稳定氮同位素比值数据,用于解析氮代谢途径的差异
  • DNA sequences.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:记录Ridgeia piscesae宿主谷氨酰胺合成酶等关键氮代谢基因的部分cDNA序列,如glnA_host基因的核苷酸序列
  • Details of qPCR assay.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:详细描述定量PCR实验的设计、引物信息及操作流程,确保基因表达数据的可重复性

数据来源

Dryad(关联研究主题:Characterizing the plasticity of nitrogen metabolism by the host and symbionts of the hydrothermal vent chemoautotrophic symbioses Ridgeia piscesae)

适用场景

  • 深海共生体氮代谢机制研究: 分析热液喷口管虫共生体的硝酸盐还原、铵盐同化等代谢途径的环境响应特性
  • 环境因子对生物代谢的调控分析: 探究温度、化学梯度等环境条件对共生体氮代谢基因表达的影响
  • 海洋生物适应策略研究: 解析Ridgeia piscesae不同表型(LS和SF)在氮营养利用上的生态适应机制
  • 分子生态学实验方法参考: 为深海生物基因表达定量(qPCR)、稳定同位素分析等实验提供方法学参考
  • 共生关系代谢互作分析: 研究宿主与共生体在氮循环过程中的功能分工与协同机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.21 MiB
最后更新 2026年1月13日
创建于 2026年1月13日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。