数据集概述
本数据集为论文“Proteolytic Activity and Substrate Specificity of Lake Geneva”的配套数据，包含2024-2025年日内瓦湖不同月份采样的MSP-MS、外切蛋白水解活性、细菌细胞及水温数据，以及生成频率热图、韦恩图和皮尔逊相关性的R脚本，共23个文件。
文件详解
- 数据文件（.xlsx，19个）
- 命名规则：按采样月份和实验类型命名（如“September 2024 Exo-proteolytic activity.xlsx”“February 2025 MSP-MS.xlsx”）
- MSP-MS数据文件：含PEAKS LFQ等工作表，记录蛋白组学分析结果（如蛋白组编号、肽段信息、无标记定量数据）
- 外切蛋白水解活性文件：记录对应月份的酶活性测定数据
- 水温数据文件：记录采样点水温剖面数据
- 代码文件（.R，3个）
- P1-P1' cleavage frequency heatmaps.R：生成切割频率热图的脚本
- Pearson's correlation.R：计算皮尔逊相关性的脚本
- P1-P1' Venn Diagrams.R：生成韦恩图的脚本
- 文档文件（.txt，1个）
- Data Files Readme.txt：描述数据文件和R脚本内容的说明文档
数据来源
Zenodo平台（对应论文“Proteolytic Activity and Substrate Specificity of Lake Geneva”）
适用场景
- 湖泊生态生物化学研究：分析日内瓦湖水体蛋白水解活性的时空变化及底物特异性
- 蛋白组学数据挖掘：利用MSP-MS数据探究湖泊微生物的蛋白表达及功能
- 生态因子相关性分析：通过皮尔逊相关性脚本研究蛋白水解活性与环境因子（如水温）的关联
- 可视化分析支持：使用R脚本生成实验结果的频率热图、韦恩图等可视化图表
- 湖泊微生物生态研究：结合细菌细胞数据解析水体微生物群落与蛋白水解过程的关系
