数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫RM2702品系(dat-1(ok157)III突变体)的行为实验记录,包含实验条件、视频采集参数及分析结果文件。实验由Laura Grundy在William R Schafer实验室完成,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,记录成年雌雄同体线虫的行为特征,属于C.elegans行为数据库的一部分。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:dat-1 (ok157) on food R_2009_11_18__11_36_5474_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件分析得到的运动、姿态等特征参数
- 行为数据压缩包
- 文件名称:dat-1 (ok157) on food R_2009_11_18__11_36_5474.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含wcon格式的线虫行为时间序列数据,记录运动轨迹等信息
- 原始分析数据文件
- 文件名称:dat-1 (ok157) on food R_2009_11_18__11_36_5474.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始分析数据,包含视频帧对应的线虫骨架分割(共19295个分割骨架)及基础参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经生物学研究:分析dat-1基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 基因功能验证:探究dat-1基因在调控线虫摄食、运动等行为中的作用机制
- 行为分析方法优化:验证tierpsy软件在线虫行为特征提取中的应用效果
- 模式生物实验复现:为同类线虫行为实验提供标准化实验条件参考
- 神经退行性疾病模型研究:以dat-1突变体为模型,研究多巴胺能神经元功能相关疾病的病理机制