数据集概述
本数据集记录了通过单核苷酸分辨率RNA足迹法,探究Mg²+浓度变化诱导RNA折叠过程中结构模块间协同作用的实验数据。包含野生型(WT)及多种突变体(如U167C、Nat+3等)的核苷酸反应性数据,反映不同Mg²+条件下RNA结构的动态变化。
文件详解
该数据集包含15个Excel格式文件,按实验对象分类如下:
- 野生型(WT)数据文件:
- 01_WT_SHAPE.xlsx:WT样本的SHAPE反应性数据
- 02_WT_DMS.xlsx:WT样本的DMS反应性数据
- 突变体数据文件(示例):
- 03_U167C_SHAPE.xlsx:U167C突变体的SHAPE反应性数据
- 03_U167C_U177C_SHAPE.xlsx:U167C/U177C双突变体的SHAPE反应性数据
- 06_A186U_DMS.xlsx:A186U突变体的DMS反应性数据
- 07_Nat+3_SHAPE.xlsx:Nat+3突变体的SHAPE反应性数据
- 10_C165A_G175U_SHAPE.xlsx:C165A/G175U突变体的SHAPE反应性数据
- 11_C165A_G175U_A186U_SHAPE.xlsx:C165A/G175U/A186U三突变体的SHAPE反应性数据
- 所有文件均为.xlsx格式,记录不同Mg²+浓度下各核苷酸的反应性数值,反应性高低对应RNA结构的配对状态(低反应性为碱基配对,高反应性为未配对/柔性状态)
适用场景
- RNA结构生物学研究:分析Mg²+对RNA折叠过程的调控机制
- 分子动力学模拟:验证RNA结构模块间的协同折叠模型
- 突变效应分析:探究特定突变对RNA结构稳定性及折叠路径的影响
- 核酸药物研发:为靶向RNA结构的药物设计提供结构动态学依据
- 生物物理实验验证:支持RNA折叠过渡态及中间结构的理论预测