溶液中蛋白G_C2片段的分子动力学模拟数据集

数据集概述

本数据集包含溶液中蛋白G C2片段的分子动力学模拟数据，记录了每皮秒保存的构型快照，模拟时长30纳秒。采用TIP3P水模型、154mM NaCl盐浓度、周期性边界条件等参数，为研究该蛋白片段的结构动态提供数据支持。

文件详解

• 文件名称: c2.psf
• 文件格式: .psf
• 内容说明: 可能包含蛋白G C2片段的结构文件，记录分子拓扑信息
• 文件名称: c2.pdb
• 文件格式: .pdb
• 内容说明: 可能包含蛋白G C2片段的坐标文件，记录原子位置信息
• 文件名称: c2-unbound_align_ca_traj.dcd
• 文件格式: .dcd
• 内容说明: 可能包含模拟轨迹文件，记录每皮秒保存的蛋白G C2片段构型快照

适用场景

• 结构生物学研究: 分析蛋白G C2片段在溶液环境中的构象变化与动态特性
• 分子动力学方法验证: 用于检验特定模拟参数（如水模型、盐浓度）对蛋白结构模拟结果的影响
• 蛋白质-溶剂相互作用分析: 探究溶液环境对蛋白G C2片段结构稳定性的作用机制
• 计算生物学教学: 作为分子动力学模拟数据案例，辅助理解蛋白动态模拟的基本原理与数据类型