蝾螈物种形成连续体中的隔离与基因流数据集

数据集概述

本数据集是为支持《蝾螈物种形成连续体中的隔离与基因流》研究而构建的DNA序列分析资料,包含用于多种系统发育分析的输入文件、数据集及脚本,为探究蝾螈物种形成过程中的基因流动与隔离机制提供数据支持。

文件详解

该数据集包含90个文件,主要分为以下三类: - 文档文件(.txt格式,共10个): - 各类分析方法的说明文件,如ReadMe_ABC_analyses.txt、ReadMe_BPP.txt、ReadMe_Concatenated_analyses_MrBayes.txt等,其中BPP相关说明文件含DNA序列比对(newts_10_1.txt)、个体分类映射(newts_10_1_map.txt)及参数控制文件等字段映射 - 其他说明文件涵盖共享单倍型计数、基因树分析、谱系分类指数等分析方法的操作说明 - 压缩文件(.zip格式,共79个): - 包含具体分析数据,如Genealogical_Sorting_Index.zip、ABC_analyses.zip、BPP.zip及以g开头的系列压缩文件(如g7.zip、g22.zip等) - 代码文件(.py格式,共1个): - count_shared_haplotypes.py:用于计算共享单倍型的Python脚本

适用场景

  • 进化生物学研究:分析蝾螈物种形成连续体中的基因流与隔离模式
  • 分子系统发育分析:支持基于MrBayes、BPP等工具的串联序列、基因树构建研究
  • 群体遗传学研究:探究蝾螈种群的单倍型共享、谱系分类指数等遗传特征
  • 生物信息学方法应用:验证ABC(近似贝叶斯计算)、Structure等分析工具在物种形成研究中的适用性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 706.57 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。