数据集概述
本数据集围绕喜马拉雅南坡Roscoea物种的海拔梯度分化展开,包含32375个非连锁SNP的系统发育分析、基因渐渗检测、物种分布模型(SDM)模拟等研究数据,用于探究喜马拉雅生物多样性起源及海拔梯度下的物种形成过程,共含4个文件。
文件详解
- 坐标数据文件
- 文件名称:coordinates_HIM.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含region(区域)、longitude(经度)、latitude(纬度)字段,记录Roscoea物种采样点的地理坐标信息
- 当前气候数据压缩包
- 文件名称:ClimateData_current.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包内为当前气候条件下的相关数据文件
- 末次盛冰期气候数据压缩包
- 文件名称:ClimateData_LGM.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包内为末次盛冰期(LGM)气候条件下的相关数据文件
- SNP数据文件
- 文件名称:Roscoea_HIM.usnps.phy
- 文件格式:PHY
- 内容说明:包含32375个非连锁SNP数据,用于重建Roscoea物种的系统发育关系及基因渐渗分析
适用场景
- 喜马拉雅物种分化机制研究:分析海拔梯度对Roscoea物种形成的影响,验证地理隔离与气候冷却驱动的分化假说
- 生物多样性起源分析:探究喜马拉雅生物多样性热点的形成原因,为区域物种起源研究提供案例
- 物种分布模型应用:利用SDM模拟数据,研究气候变迁下Roscoea物种的栖息地迁移规律
- 基因渐渗模式分析:通过D统计量和Fastsimicoal2结果,解析海拔邻近类群间的基因交流特征
- 山地物种适应进化研究:结合海拔梯度与基因数据,揭示Roscoea物种对极端环境的适应机制