数据集概述
本数据集围绕疟疾媒介按蚊（Anopheles funestus）的rp2 QTL定位克隆展开，包含与拟除虫菊酯抗药性相关的P450基因（CYP6Z1、CYP6Z3、CYP6M7）及相关基因的序列、基因型和表达数据。通过BAC克隆测序、SNP鉴定、QTL定位和基因表达分析，揭示抗药性机制，为疟疾防治提供基因层面的研究基础，总计包含6个文件。
文件详解
- rp2 BAC全序列文件
- 文件名称：Full sequence of rp2 BAC 23 07 12.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：包含覆盖rp2 QTL区域的113 kb BAC克隆的全序列数据，涉及15个P450基因和1个唾液蛋白基因的序列信息
- CYP6Z3全长克隆序列文件
- 文件名称：CYP6Z3 cloned full length for FG FZ 23 07 12.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：按蚊抗药性相关基因CYP6Z3的全长克隆序列数据
- QTL定位基因型文件
- 文件名称：Genotype file for Family 1 and 10 for QTL mapping.Loc
- 文件格式：LOC
- 字段映射介绍：用于F6代高级互交系（AIL）中Family 1和Family 10的QTL定位分析的基因型数据
- qRT-PCR数据及PCR效率文件
- 文件名称：qRTPCR data and PCR efficiencies.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含15个P450基因及相关基因（如GSTe2）的定量RT-PCR表达数据，涉及抗药性品系（FUMOZ-R）与敏感品系的表达量对比、折叠变化值及PCR扩增效率数据
- CYP6Z1全长克隆序列文件
- 文件名称：CYP6Z1 cloned full length for FG FZ 23 07 12.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：按蚊抗药性相关基因CYP6Z1的全长克隆序列数据
- SNP鉴定DNA序列文件
- 文件名称：DNA sequences for SNP identification 23 07 12.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：用于rp2 QTL区域P450基因及其他基因SNP鉴定的DNA序列数据，共识别565个新SNP
数据来源
论文“Positional cloning of rp2 QTL associates the P450 genes CYP6Z1, CYP6Z3 and CYP6M7 with pyrethroid resistance in the malaria vector Anopheles funestus”
适用场景
- 疟疾媒介抗药性机制研究：分析P450基因（CYP6Z1、CYP6Z3、CYP6M7）与按蚊拟除虫菊酯抗药性的关联机制
- 抗药性基因分子标记开发：基于SNP数据开发按蚊抗药性监测的分子标记
- 抗药性基因表达分析：利用qRT-PCR数据研究抗药性品系与敏感品系的基因表达差异
- 疟疾防治策略优化：为非洲疟疾控制中拟除虫菊酯类杀虫剂的合理使用提供基因层面的科学依据
- 昆虫抗药性进化研究：通过基因序列和基因型数据探究按蚊抗药性的进化规律
