数据集概述
本数据集围绕加勒比海八放珊瑚Eunicea flexuosa的幼体与成体混合区展开，包含不同深度谱系的频率分布、分子标记数据、形态特征及混合区特征频率等信息，用于研究自然选择如何维持窄混合区及物种形成机制，共含11个文件。
文件详解
- 分子序列文件（.phy格式，共8个）
- 文件名称：msh.phy、I3P.phy、gly3p.phy、564.phy、psbA.phy、EF1A.phy、1633.phy等
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：存储珊瑚及其共生藻的分子标记序列数据，用于谱系鉴定与遗传分析
- 基因型数据文件
- 文件名称：Juvenile_adult_genotypes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含幼体与成体的基因型信息，用于分析不同年龄组的谱系频率变化
- 混合区特征频率文件
- 文件名称：HZAR_cline_character_frequencies.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：含locationID（站位ID）、Distance.Depth（深度距离）、Real.distance（实际距离）、各分子标记（如msh、glyp3）的样本量与频率、Mean.hybrid.Index（平均混合指数）、形态特征（如spindle.length纺锤长度、Branchthickness分支厚度、Calicediameter杯径）等字段
- 说明文件
- 文件名称：README_for_msh.phy
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：提供msh.phy文件的说明信息
- 站位信息文件
- 文件名称：eflexuosaLocations
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：记录珊瑚采样站位的基础信息
数据来源
论文“Strong natural selection on juveniles maintains a narrow adult hybrid zone in a broadcast spawner”
适用场景
- 海洋物种形成机制研究: 分析幼体阶段自然选择如何维持成体窄混合区，探究高扩散物种的物种形成过程
- 珊瑚遗传与形态特征关联分析: 结合分子标记与形态特征数据，研究珊瑚基因型与表型的对应关系
- 混合区动态分析: 利用混合指数与特征频率数据，解析珊瑚混合区的宽度、梯度及维持机制
- 生态选择压力评估: 通过幼体与成体谱系频率差异，量化自然选择对不匹配基因型的选择系数
- 共生藻与宿主协同进化研究: 分析珊瑚宿主与共生藻的分子标记共梯度变化，探究协同适应机制
