数据集概述
本数据集包含用于RUCova方法（大规模细胞术数据非目标协方差去除）的实验数据与分析文件，涵盖多种细胞系的大规模细胞术数据、细胞面积测量数据及可复现研究结果的R Markdown报告，支持理解RUCova方法的应用。
文件详解
- 大规模细胞术数据文件（CSV格式）：
- data1_HNSCC.csv：10种头颈部鳞状细胞癌细胞系在对照组及10Gy照射48小时后的细胞术数据，含singlets和low_Pt（非死细胞）逻辑列
- marker_category_HNSCC.csv：细胞术检测面板中各标记物及其类别的对照表
- data2_FACS.csv：Cal33细胞系经不同刺激并按大小分选后的FACS数据
- data3_ru.csv：Cal33细胞系钌染色相关数据
- data_ruthenium_rapsomaniki.csv：引用自Rapsomaniki et. al. 2018的钌染色数据
- 细胞面积测量数据（CSV格式）：
- cell_area_HNSCC.csv：10种HNSCC细胞系在对照组及10Gy照射后的细胞面积（μm²）测量数据，含line（细胞系）、dose（照射剂量）字段
- 分析报告与图像文件：
- analysis.Rmd：R Markdown格式的分析脚本
- analysis.html：HTML格式的分析报告输出
- size_gates.png：FACS分选大小门控的示意图
适用场景
- 生物信息学研究：验证和应用RUCova方法去除大规模细胞术数据中的非目标协方差
- 细胞生物学分析：研究头颈部癌细胞系受辐射后的表型与分子标志物变化
- 实验结果复现：基于R Markdown报告复现相关研究的图表与结论
- 细胞分选技术研究：分析FACS大小分选对细胞数据的影响
