数据集概述
该数据集包含瑞典斯托达伦泥炭地1,864个97%去冗余宏基因组组装基因组(MAGs)的DRAM注释结果,通过DRAM v1.4.0工具生成,提供基因组功能注释及代谢总结数据。
文件详解
- 1864_97percentmags_annotations_combined.tsv.gz:压缩TSV格式文件,可能包含所有MAGs的DRAM功能注释原始数据
- 1864_97percentmags_metabolism_summary.xlsx:Excel格式文件,可能汇总各MAGs的代谢通路分析结果
- product_0.html:HTML格式文件,可能为注释结果的可视化报告或产品说明文档
- product_1.html:HTML格式文件,可能为另一部分注释结果的可视化报告或补充说明文档
数据来源
EMERGE Biology Integration Institute、瑞典极地研究秘书处、SITES、美国国家科学基金会、美国能源部基因组科学计划、DOE联合基因组研究所、环境分子科学实验室
适用场景
- 微生物生态学研究:分析斯托达伦泥炭地微生物群落的功能基因组成与代谢潜力
- 环境基因组学分析:探究泥炭地生态系统中微生物对碳氮循环等生物地球化学过程的贡献
- 宏基因组数据注释方法验证:作为案例数据测试或优化宏基因组组装基因组的功能注释流程
- 极端环境微生物研究:挖掘寒冷泥炭地特殊环境下微生物的适应性功能基因