乳腺癌细胞周期分析单细胞RNA测序数据集-2021-alexandervc
数据来源:互联网公开数据
标签:单细胞RNA测序,乳腺癌,细胞周期,基因表达,p53,CENP-A,细胞生物学,科研,数据分析
数据概述:
本数据集收录了对乳腺癌细胞系MCF10-2A进行单细胞RNA测序的结果。具体而言,数据集中包含了在p53基因开启/关闭状态及CENP-A基因过表达条件下,细胞的基因表达情况。数据集由Daniel Jeffery等人在《Nature》期刊上发表的研究成果提供,详细讨论了细胞周期分析的结果。数据集中,每一行代表一个细胞,每一列代表一个基因(或反之),矩阵中的数值显示了相应基因在相应细胞中的表达强度。
数据集来源于欧洲生物信息学研究所(EBI)的ArrayExpress数据库,具体网址为https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-9861/。此外,用户可以通过Kaggle网站找到其他单细胞RNA测序数据集,例如https://www.kaggle.com/alexandervc/datasets。
数据用途概述:
该数据集适用于单细胞转录组学研究、细胞周期分析、基因表达模式研究、癌症生物学研究等多种场景。研究人员可以利用此数据集进行单细胞水平的基因表达分析,探索不同基因条件下细胞的细胞周期变化;生物信息学专家可以使用该数据集开发和测试单细胞RNA测序数据分析的算法和工具;教师可以利用此数据集进行教学和科研培训。此外,对于单细胞数据科学领域的研究者而言,本数据集提供了宝贵的研究材料,有助于解决单细胞RNA测序中的计算和分析挑战。